哥斯拉破坏日本多年，〈G对策总部〉发明黑洞炮对付。但实验出意外，引来古代巨大昆虫超翔龙重现，并攻击哥斯拉。日本成了哥斯拉、超翔龙及人类三方的战场。。米奇在一天早晨发现了自己最心爱的几个月大的女儿并非自己亲生，精神接近崩溃的他踏上了寻找“罪魁祸首“的路。就在这段旅途中，米奇获得了人生的真正意义，并且接受了一切，一家人幸福地生活在一起。。
